Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms