Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3C2AO00443 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3C2AO00443 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3C2AO00443 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3C2AO00443 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3C2AO00443 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3C2AO00443 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3C2AO00443 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3C2AO00443 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3C2AO00443 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3C2AO00443 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3C2AO00443 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms