Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1E9PL57 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms