Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
B4DGG1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DGG1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DGG1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DGG1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DGG1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DGG1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DGG1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
B4DGG1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
B4DGG1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DGG1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms