Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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C4orf47A7E2U8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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C4orf47A7E2U8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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C4orf47A7E2U8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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C4orf47A7E2U8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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C4orf47A7E2U8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4orf47A7E2U8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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