Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CFAP73A6NFT4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms