Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA3Q9Y6H8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms