Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9Y3F1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9Y3F1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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