Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms