Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms