Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYH13Q9UKX3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYH13Q9UKX3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms