Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DKK4Q9UBT3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms