Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMOD2Q9NZR1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMOD2Q9NZR1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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