Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX2Q9NRD8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX2Q9NRD8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms