Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NRIP3Q9NQ35 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms