Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZC3H12CQ9C0D7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms