Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRNKL1Q9BZJ0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRNKL1Q9BZJ0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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