Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms