Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 OR52B5P-203ENST00000641694 1313 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 AP001885.1-202ENST00000444002 1255 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 TCAIM-208ENST00000444602 1056 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF23Q9BUL5 RBM5-AS1-201ENST00000630404 1386 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 SPRR3-202ENST00000331860 985 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 AADACP1-203ENST00000471766 707 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF23Q9BUL5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms