Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZBED2Q9BTP6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms