Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EBF4Q9BQW3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EBF4Q9BQW3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms