Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC43Q96MW1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms