Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YTHDC1Q96MU7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms