Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCC1Q92922 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms