Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX54Q8TDD1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms