Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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