Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF439Q8NDP4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF439Q8NDP4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms