Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z494

NPHP3, Nephrocystin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3Q7Z494 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHP3Q7Z494 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms