Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP43Q70EL4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms