Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms