Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBR3Q6ZT12 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBR3Q6ZT12 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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