Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC9Q6ZRR7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms