Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CD109Q6YHK3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms