Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRAIDQ6UW56 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRAIDQ6UW56 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms