Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC4Q6P2E9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC4Q6P2E9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms