Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JMJD6Q6NYC1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms