Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms