Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD4Q5VX71 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms