Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHYHD1Q5SRE7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms