Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDCA8Q53HL2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA8Q53HL2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms