Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIS6

ZNF528, Zinc finger protein 528, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF528Q3MIS6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF528Q3MIS6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF528Q3MIS6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF528Q3MIS6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF528Q3MIS6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF528Q3MIS6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF528Q3MIS6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF528Q3MIS6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF528Q3MIS6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF528Q3MIS6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms