Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC96Q2M329 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC96Q2M329 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms