Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PFKFB3Q16875 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PFKFB3Q16875 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PFKFB3Q16875 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PFKFB3Q16875 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PFKFB3Q16875 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PFKFB3Q16875 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PFKFB3Q16875 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PFKFB3Q16875 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PFKFB3Q16875 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PFKFB3Q16875 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PFKFB3Q16875 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PFKFB3Q16875 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PFKFB3Q16875 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms