Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TNXAQ16473 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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