Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP6AP1Q15904 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP6AP1Q15904 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms