Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNIP1Q15025 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms