Protein–RNA interactions for Protein: Q14D33

RTP5, Receptor-transporting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP5Q14D33 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTP5Q14D33 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms