Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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GPNMBQ14956 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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