Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSHL1Q14406 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
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