Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCARF1Q14162 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARF1Q14162 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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